En 1944, les troupes hitlériennes ont gagné la guerre, suite à de nombreuses et impressionnantes victoires. Personne ne sait comment Hitler et ses généraux ont fait pour faire basculer le cours de la guerre et régner sur le monde après avoir fait tomber les villes de Londres, Moscou et Washington. Les Nazis dominent alors le monde.

En l'année 2093, le monde est au bord de la ruine : le climat a changé.

Le joueur incarne Sebastian Mortyr, fils du général Jurgen Mortyr. Jurgen, ayant des remords, accuse les nazis d'avoir dominé le monde et asservi l'humanité. La seule chance de sauver le monde est de revenir en 1944 (via un voyage temporel) afin de changer le cours des choses.

End of War 1945