Les humains se sont lancés à la conquête de l'espace. Ils se heurtent aux troupes de l'Empire Helghast, fondé par des descendants des premiers colons humains de la planète Helghan. Les conditions naturelles de cet astre sont telles qu'elles ont opéré au fil des générations des mutations sur les habitants d'Helghast. À quelques rares exceptions, ils doivent porter un masque à gaz qui est relié à un système leur fournissant le mélange spécial dont ils ont besoin pour respirer. Ils sont devenus aussi plus rapides et plus forts que leurs lointains cousins humains, auxquels ils vouent une haine fraternelle. Dans l'épisode précédent, l'empire s'était lancé à l'attaque de la planète Vekta, mais avait été repoussé grâce à l'héroïsme des forces de l'ISA (Interplanetary Strategic Alliance), une alliance entre diverses colonies spatiales.

Mais la menace est toujours présente et l'ISA décide 2 ans après d'aller mettre un terme aux désirs expansionnistes de l'Empire. Pour limiter le bain de sang, le plan de l'ISA est simple : capturer l'Empereur Visari. Le joueur incarne Sev, un militaire vétéran qui appartient à un commando d'élite : l'unité Alpha. Alors que les forces militaires de l'ISA partent à la conquête d'Helghast, Sev et ses hommes sont expédiés derrière les lignes ennemies pour aider leurs camarades à briser les défenses de l'Empire.

Hectic Void

Exophobia