Mindjack se déroule aux Etats-Unis, dans un futur proche, dans un monde contrôlé par de gigantesques multinationales où la technologie est omniprésente.
Pour Jim Corbijn, un agent de la Federal Intelligence Agency, tout commence par une simple opération de surveillance visant Rebecca Weiss, une écoterroriste de retour de Shanghai. Lorsque cette mission à priori banale se transforme en fusillade meurtrière, Jim et Rebecca sont contraints d’unir leurs forces pour échapper à la mystérieuse milice privée qui cherche à les éliminer.
Lancés dans une fuite éperdue qui les conduira des murs de briques vieillissants d’Old Town aux tours de verre et d’acier de New City, ils découvrent alors l’existence d’une vaste conspiration remontant jusqu’au sommet du gouvernement.
Ainsi commence leur dangereuse quête de vérité. L’une des corporations les plus puissantes au monde essaye désespérément de dissimuler quelque chose.