Rejoignez une organisation secrète omniprésente, responsable de la protection contre les menaces invisibles du 21e siècle face auxquelles les autres agences sont impuissantes. Elle ne fait appel qu'aux meilleurs agents et qu'aux technologies de pointe, mais elle n'est pas la seule...
Un groupe très influent projette d'utiliser le clonage à des fins qui pourraient être désastreuses pour l'humanité.
Bienvenue dans l'ère de la domination mondiale du 21e siècle. Bienvenue dans Silent Ops.

Parmi les 7 niveaux que compose le jeu (Genève, Dubrovnik, Hong Kong, etc.), vous avez la possibilité d'incarner 3 agents ayant chacun leurs propres compétences : John Oaks, maître du combat rapproché et de l'espionnage ; Yuri Sokolov, tireur d'élite ; Nicole Loiseau, experte en véhicules et informatique.