Quatre mois se sont écoulés depuis que Kal Wardin a mis en échec les plans des Volterites en sabotant leurs usines de guerre et en empêchant l'extraction des artefacts des Juges. Cependant, après l'assassinat du président Folsom, le gouvernement a cédé des colonies aux Volterites pour éviter une guerre civile entre les citoyens pro-Volterites de plus en plus nombreux et les autres. Kal Wardin s'est fait plutôt discret depuis la mort de Folsom, mais Yelena l'a supplié de revenir sur Terre. Encore une fois, notre héros doit sauver l'humanité.

N.O.V.A. 3 est un FPS qui exploite notamment le GPU PowerVR SGX 543MP4 et l’écran Retina du nouvel iPad ou la solution Tegra de Nvidia qui anime bon nombre de tablettes sous Android.

Le mode multi-joueur en ligne ou en local est toujours présent et étendu à 12 terminaux contre 10 auparavant.

En octobre 2014, une version gratuite du jeu (mais avec de la publicité) appelée N.O.V.A. 3 : Freedom Edition est sortie.

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